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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  32 lines
  1. **************************************************************
  2. * Alpha-isopropylmalate and homocitrate synthases signatures *
  3. **************************************************************
  4.  
  5. The following enzymes have  been  shown [1] to  be  functionally  as  well  as
  6. evolutionary related:
  7.  
  8.  - Alpha-isopropylmalate synthase (EC 4.1.3.12) which catalyzes the first step
  9.    in the biosynthesis of leucine,  the  condensation of acetyl-CoA and alpha-
  10.    ketoisovalerate to form 2-isopropylmalate synthase.
  11.  - Homocitrate synthase (EC 4.1.3.21) (gene nifV)  which  is  involved  in the
  12.    biosynthesis of the iron-molybdenum cofactor  of nitrogenase and  catalyzes
  13.    the condensation of acetyl-CoA and alpha-ketoglutarate into homocitrate.
  14.  
  15. We have selected  two   conserved  regions  as  signature patterns  for  these
  16. enzymes.  The first region  is located in  the  N-terminal section  while  the
  17. second region is located  in the  central section  and  contains two conserved
  18. histidine residues which could be implicated in the catalytic mechanism.
  19.  
  20. -Consensus pattern: T-x-L-R-D-G-x-Q-x(10)-K
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Consensus pattern: [LIVMF]-x(2)-H-x-H-[DN]-D-x-G-x-[GAS]-x-[GAS]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27.  
  28. -Last update: October 1993 / First entry.
  29.  
  30. [ 1] Wang S.-Z., Dean D.R., Chen J.-S., Johnson J.L.
  31.      J. Bacteriol. 173:3041-3046(1991).
  32.